阴茎的大小在各民族、各种族之间差异非常大，以我国汉族成年男性为例，阴茎在疲软的时候，也就是静息状态下，通常是5-6cm。如果是在拉伸长度下或者是在勃起长度下，通常是11-13cm，低于这个标准1cm左右，通常认为正常。但是一般认为在静息状态下小于4cm，勃起状态下小于7cm，或者有效勃起长度小于9.5cm，认为是阴茎短小。
临床上很多认为自己阴茎短小的人其实是测量方法有误，阴茎测量的方法应该是用直尺紧紧抵住耻骨联合，测量自耻骨联合到阴茎尖端全部的长度，是真实长度。对于肥胖、隐匿性阴茎或者蹼状阴茎的患者，应该尽量推开脂肪或者多余的组织，才能测量真实的阴茎长度。