喉咙里被查出有囊肿时必须通过手术的切除方法进行治疗，一般的药物疗效对体内的囊肿是起不到任何作用的。喉咙里的囊肿分为黏液囊肿和气囊肿，每位患者喉咙囊肿的性质不同，手术的切除方法也是不同的。
如果喉咙里的囊肿过小、生长速度过缓，并且不影响正常的生活和饮食吞咽，这种情况下暂时不需要任何方法处理，只要平时多观察囊肿的生长变化就行。
如果囊肿的生长速度出现过快时就需要及时手术切除，喉咙里的囊肿生长快而且没有得到及时治疗，一般情况下会影响正常呼吸，患者会伴有喉咙疼痛，吃东西时会出现吞咽困难的情况，严重时囊肿会发生性质改变。