肛门旁边的肉疙瘩是否会自己愈合要看是什么原因造成的肉疙瘩。适于愈合的属于炎性疾病，比如肛门周围的毛囊炎，通过自己的调理是完全可以愈合的。
如果是局部的湿疹样改变，自己愈合也是有可能的。如果是痔疮一般自己愈合的可能性不大，一旦形成就不会消失。但是由于它是良性疾病，定期观察就可以。
如果发现肛门旁边有肉疙瘩比较大，而且不断增大，建议及时就医完善相关的检查，明确肉疙瘩的具体原因后，再根据不同的病因，采取相对应的治疗方式。