大多数的蛋白尿提示有肾小球的损伤，少数情况下可能与肾小管间质损伤有关。蛋白尿要根据病因进行药物治疗，最常见的是原发性慢性肾小球肾炎。
如果患者24小时尿蛋白定量超过1g以上，就需要根据肾脏病理来决定是否使用糖皮质激素，或者糖皮质激素联合免疫抑制剂进行治疗，常用的免疫抑制剂是环磷酰胺、他克莫司、环孢素等。
如果患者是糖尿病肾病，需要使用口服降糖药或者胰岛素控制血糖。狼疮性肾炎的患者也需要使用激素等药物。患者是老年人，要考虑可能是多发性骨髓瘤，明确诊断以后还需要口服化疗药物。