避孕药的主要危害是对于年龄较大的女性，会增加血栓形成的风险。一般如果需要长期口服避孕药，要看年龄，一般40岁以上的女性就不建议长期口服短效避孕药了。避孕药还会有一些副作用，主要的副作用是类早孕反应。在服用避孕药以后可能会出现一些恶心、头晕、乏力、困倦、食欲缺乏、乳房胀痛等像早孕反应一样的症状。这些症状主要是由于避孕药中的雌激素刺激胃黏膜所引起的，大多数是不需要处理的。
另外可能会出现阴道出血，主要是突破性出血。发生阴道出血，往往是由于药物的漏服、吃药时间不定时所导致的，还有是服药方法错误这种情况引起的，所以一定要规范服药。吃药以后可能会引起停经或者月经过少，绝大多数停经或者月经过少的女性在停药以后是可以自行恢复的。如果停药以后月经仍然不来，可以在停药的第七天开始服用下一个周期的避孕药。口服避孕药以后可能也会出现食欲比较好，造成体重增加的现象，这种也是正常的现象。