输尿管狭窄手术后遗症包括早期的后遗症和后期的后遗症。早期后遗症多于手术后一周内出现，可能出现：
1、寒战、高热。常常见于手术后感染，感染包括吻合口处的感染、泌尿道的感染和伤口感染等情况，当感染发生时可出现寒战、高热、腰痛、血尿、脓尿等症状。
2、吻合口瘘。手术后以吻合不全而导致漏尿或者继发性感染而导致吻合口瘘，这时尿液一部分流入膀胱，一部分流入伤口周围形成脓肿。
后期的并发症包括：
1、术后输尿管仍然狭窄。吻合后局部瘢痕形成或者感染后导致局部愈合不良而形成瘢痕，术后仍出现输尿管狭窄、通畅性不良而肾脏积水、肾损害等并发症。
2、术后出现吻合口的结石或占位等病变。因吻合后局部残留有缝线等而出现局部生长结石，致使输尿管再次梗阻、引流不畅、腰痛或者尿频、尿急等症状。