孕妇如果明确诊断存在有肾脏结石，目前只能够通过药物治疗来缓解肾结石引起的一些症状，比如肾结石出现了明显肾绞痛，注射黄体酮针剂、山莨菪碱针剂、间苯三酚针剂持续3-5天能够有效缓解疼痛，并且这些药物对胎儿不会产生任何影响。
同时也要口服一些敏感的抗生素，比如阿奇霉素片、头孢呋辛酯片、阿莫西林胶囊，只要控制好尿路炎症感染，肾脏结石就不容易引起疼痛。
如果肾结石引起了比较明显的肾脏积水，可以通过局部麻醉下输尿管置管来引流肾脏积水、保护肾脏功能，等到生完小孩以后再通过碎石的方法清除结石。