一般甲胎蛋白的明显增高，能够提示有原发性肝癌和生殖细胞恶性肿瘤存在可能，其中大概有80%的原发性肝癌患者，血清中的甲胎蛋白可以升高，而大约有50%左右的原发性肝癌患者，可以检测到高浓度的甲胎蛋白。
但是，需要注意一些良性的肝脏疾病，比如肝炎、肝硬化的病人，采血查甲胎蛋白的时候也可以见到增高的现象，绝大多数会小于200μg/L的数值。除了原发性肝癌之外，甲胎蛋白的明显增高，还可以见于以精原细胞瘤为代表的生殖细胞恶性肿瘤。