自身免疫性甲状腺炎是临床上最常见的一类甲状腺炎，自身免疫性甲状腺炎分为以下五种类型：
第一、桥本甲状腺炎，是临床上最常见的自身免疫性甲状腺炎，常具有家族的多发性。
第二、萎缩性甲状腺炎，又被称为特发性的甲状腺功能减退症、原发性黏液性水肿，可以出现甲状腺的萎缩，大多数伴有甲状腺功能减退症。
第三、甲状腺功能正常的甲状腺炎，主要表现为甲状腺淋巴细胞浸润、甲状腺过氧化物酶抗体和甲状腺球蛋白抗体阳性，但是甲状腺功能正常。
第四、无痛性甲状腺炎。
第五、一种自身免疫性的甲状腺炎，与另外一种甲状腺自身免疫性疾病共存，例如桥本甲状腺炎和Graves病在一个人身上同时存在。