电脉冲按摩对身体是否有害主要取决于使用的方式以及时间。电脉冲按摩使使用低频电流，刺激局部肌肉，使肌肉收缩、舒张，从而达到缓解肌肉疲劳的目的。根据目前有限的研究结果显示，对肌肉疲劳有一定的治疗作用。
但是，电脉冲治疗由于使用的电刺激，引起肌肉周期性的震颤。这种震颤在其他疾病中，可能出现局部的血管硬化、痉挛，从而导致身体周围小动静脉闭缩、供血不足的情况。所以，电脉冲按摩虽然有一定的疗效，但仍要注意使用的时间以及方式，避免长时间使用以及局部组织缺血的症状。