睡觉醒来小手指发麻主要是由以下原因导致的：
1、临床上最常见的原因是中风以及中枢神经感染。长期患有高血压、高脂血症的患者会因为局部的血栓形成，尤其是脑部血栓形成，会造成局部的脑组织缺血，从而引起中风的先兆，在早期就会频繁出现手指发麻的症状，出现中枢神经感染之后会引起脑组织损伤，神经支配的区域就会出现感觉障碍，从而出现手指发麻或者乏力的症状。
2、出现免疫系统疾病或者代谢功能障碍，例如B族维生素缺乏、叶酸缺乏等，也会引起手指指端部位有感觉异常，从而导致麻木的症状。