如果患者患有肾脏结石，行微创手术进行治疗，这时手术风险有以下几个：
第一个，输尿管较细，输尿管镜无法进入，导致手术失败。
第二个，由于微创手术需要将碎石用的管道插入泌尿道内，这样就可能会损伤泌尿道的黏膜，甚至导致泌尿道穿孔等风险。
第三个，如果手术中无菌操作不规范，可能会导致管道将病原体带到泌尿道，这样就大大的增加泌尿道的感染风险。
第四个，可能会导致患者在短时间内出现肾结石复发的情况，主要是因为微创手术没有完全将肾脏内的小结石取出，这样就可以导致术后复发的情况。