吞咽不协调是指由于咽喉部的肌肉和支配咽喉部的肌肉的神经的病变，所引起来的吞咽的困难或者出现饮水的呛咳，多半是伴有吐词不清楚。
引起吞咽不协调的病因，主要是包括以下几个方面：
第一、喉部的病变，比如喉部的肿瘤发展到一定程度以后，会出现吞咽困难、吞咽不协调。
第二、急性脑血管病，比如脑干的梗塞、小脑梗塞或者出血，影响了疑核和舌咽迷走神经以后，出现饮水呛咳和吐字不清楚，甚至伴有吞咽的困难。
第三、有些神经系统的变性疾病，比如运动神经元病，主要也会出现吞咽的不协调、吞咽困难、饮食和进水呛咳。