目前确诊新型肺炎的主要方法就是进行核酸的检测，病毒的核酸检测可以用咽拭子，可以用痰以及下呼吸道的分泌物，还可以用血液以及粪便等标本检测冠状病毒的核酸。
发病早期病人可以合并外周血白细胞总数的正常或者减少，也可以有淋巴细胞计数的减少，一部分病人可能会出现肝酶和心肌酶的升高，危重的病人甚至可以检测出肌钙蛋白升高，多数病人是血沉及C-反应蛋白升高，但是他们的降钙素原正常，严重的可能合并D-二聚体的升高。
胸部X片检查可见多发的小斑片状阴影以及间质的改变，其中以肺外带明显，进一步进展就会发展成为双肺多发的磨玻璃影、浸润影，甚至可以发现肺实变，这些都可以确诊新型肺炎。