偶尔的同房后小肚子痛一般与同房姿势不当相关，有时也与同房后引起宫缩，宫缩导致腹痛相关，这种情况不用特殊处理，会自行好转。
如果经常有同房后腹痛，就要做妇科检查除外子宫内膜异位症、盆腔炎等特殊情况。子宫内膜异位症常常表现为阴道后穹窿触痛结节，如果同房碰到这些触痛结节，就会引起性交痛，查体可以明确诊断。
对于子宫内膜异位症，要给予相应的特异药物和手术治疗。同房后小肚子痛也要除外盆腔炎，盆腔炎常常有慢性腹痛，查体附件区增厚、压痛，是盆腔炎的特异体征。
对于盆腔炎，要给予抗生素结合活血化瘀类的中药治疗。