新型冠状病毒肺炎阴性就指核酸检测是阴性，阳性就指的核酸检测是阳性结果，核酸检测阳性结果是确诊新型冠状病毒肺炎的金标准，所以，如果核酸检测阳性，就可以诊断是新型冠状病毒肺炎，阴性可以排除新型冠状病毒肺炎。但是由于核酸检测时容易出现假阴性，主要是受到病程检测试剂检测过程以及标本采集的影响，会出现假阴性，所以一次假阴性也不能完全排除新型冠状病毒肺炎。
如果有高度可疑时，可以反复进行核酸检测，每次核酸检测至少应该间隔24小时。另外核酸检测时采集的标本，下呼吸道分泌物阳性率更高，所以也可以采集下呼吸道的分泌物，如痰液也可以，都比咽拭纸阳性率要高。