起床腰疼而一会就好了可以有以下几种原因：
第一、腰背肌筋膜炎，腰背肌筋膜炎常见于长期弯腰持物、腰部着凉以及劳累，这时可以出现腰部筋膜的慢性的无菌性炎症，而出现疼痛，常在晨起之后疼痛比较明显，而在活动一会之后就能够有所减轻，这时要早期的进行相关的查体以及检查，排除其他的疾病来进行诊断；
第二、腰肌劳损，腰肌劳损的患者也可以出现腰疼，在晨起时腰疼非常明显，而在活动一会之后就能有所好转；
第三、类风湿性的疾病，比如类风湿性脊柱炎以及强直性脊柱炎，也可以出现晨起时腰疼，在活动一会之后就能有所好转，可以伴有晨僵的症状，这时要进行腰椎的X线片、CT、核磁检查以及血的化验，来进行诊断和治疗。