来月经的时候大便肛门疼痛，有可能是痛经导致，或者子宫内膜异位到直肠引起。痛经比较严重的女性，月经期间有可能会出现下腹部，以及盆腔肌肉痉挛的疼痛，严重的情况可能会有全身症状，一般建议吃止痛药，比如布洛芬或者消炎痛来缓解，也可以用双氯芬酸钠塞肛门缓解症状，平时一定要多注意保暖，可以用暖宝贴热敷下腹部。
另外，如果平时痔疮比较严重或有肛裂，也有可能再来月经的时候有肛门疼痛的症状，大便时可能会加重，建议到肛肠外科就诊，平时要清淡饮食，不能吃辛辣、刺激性的食物，如果有急性盆腔炎症或者急性腹膜炎，也有可能会有这种症状。