如果是抗过氧化物酶抗体偏高，而甲状腺功能正常，不需要特别的治疗，正常吃饭，没有必要使用各种药物。过氧化物酶是甲状腺合成甲状腺激素很重要的成分，免疫系统如果把它当成了敌人，产生防御反应，叫做自身免疫，会产生抗过氧化物酶抗体。这个抗体并不是直接损伤甲状腺，但是由于自身免疫反应才影响甲状腺，造成甲状腺开始的时候有些肿大，但是往往最终会明显的变小。
甲状腺组织有可能造成损伤，可以出现一过性的像甲状腺激素水平增高，叫慢性淋巴细胞性甲状腺炎引起的甲亢，最后会出现甲状腺功能减退。如果化验发现甲状腺激素水平正常，仅仅是抗甲状腺过氧化物酶体轻度的偏高，不需要特别治疗，包括正常吃饭，无需选择无碘的盐或者有碘低盐，海带、紫菜正常吃，没有必要不吃含碘的食物或者是过量吃，更没有必要使用所谓硒制剂降低抗甲状腺过氧化物酶抗体。如果是甲状腺功能出现问题，比如出现甲亢，或者是甲状腺功能减退，需要对病症进行治疗。