胃窦溃烂严重不严重，还要看胃窦溃烂的大小以及深度。如果溃烂的面积比较大，深度比较深，就比较严重，但是一般情况下胃窦溃烂现在药物治疗效果都比较好，比如质子泵抑制剂，如雷贝拉唑、泮托拉唑、奥美拉唑，加一种胃黏膜保护剂，如胶体果胶铋、铝酸铋等，6-8周就可以治愈。
如果比较大的溃疡，特别是表面覆有污苔，一定要警惕癌变的可能。溃疡都可以引起穿孔，如果引起穿孔，则可引起急性腹膜炎。所以一旦发现胃窦有溃烂，应该及时的治疗，药物治疗效果不好，则要考虑手术治疗，如果有癌变，应该立即切除。