低镁血症的常见原因有以下几个方面：
第一、小肠吸收障碍，比如像严重的腹泻、吸收不良综合征、溃疡性结肠炎、肠道大部分切除术后、肝硬化以及胆道的疾病和克罗恩病等，导致小肠吸收镁障碍，引起低镁血症。
第二、醛固酮分泌增多，比如像心衰的患者由于水钠潴留，常常会伴有继发性的醛固酮分泌增多。醛固酮分泌增多就会使肠道镁吸收和肾小管镁重吸收减少，原发性醛固酮增多症患者也可以表现有低镁血症。
第三、肾脏的疾病，比如慢性肾盂肾炎、肾小管酸中毒的部分患者也可以伴有肾小管重吸收功能的减退，导致肾小管镁重吸收减少，引起低镁血症。