头皮上起小疙瘩，临床上多见的是发生在头皮的毛囊炎。毛囊炎的发生主要与头皮的皮脂腺分泌过多、毛囊、皮脂腺导管堵塞、细菌感染和炎症反应等因素密切相关，进入青春期以后，人体内的雄激素水平升高，雄激素促进了皮脂腺的发育，并产生大量的皮脂。同时毛囊、皮脂腺导管内的角化异常，造成毛囊、皮脂腺导管的堵塞，皮脂排出障碍形成角质栓，也就是微粉刺，以及皮脂内化学成分的改变，造成皮肤表面菌丛失调，某些细菌如痤疮丙酸杆菌和卵圆形糠秕孢子菌，大量繁殖和生长。
毛囊内的多种微生物，尤其是痤疮丙酸杆菌，大量繁殖产生游离脂肪酸，侵蚀和破坏毛囊壁，而产生炎症性的、毛囊性的皮肤损害。某些局部的因素，如汗液的浸渍、脂垢腐败、分解、摩擦、理化刺激等，又加重了毛囊性炎症的反应。炎症期性的毛囊性丘疹，进一步发展形成毛囊炎，同时趋化炎症细胞和介质，最终导致并加重毛囊炎的炎症反应，患者可以口服米诺环素，外用抗菌素的药膏或过氧苯甲酰软膏，去除头部的小红疙瘩。