左卡尼汀的副作用主要涉及消化系统、呼吸系统、心血管系统以及神经系统，左卡尼汀是氨基酸类的营养药物。左卡尼汀可以导致血压异常、心律失常等心血管系统反应，同时服用左卡尼汀可能会引起咳嗽、咽喉炎、鼻炎、鼻窦炎、支气管炎、呼吸困难等呼吸道症状。左卡尼汀还可能会引起头痛、头晕、失眠、癫痫发作、感觉异常以及焦虑、抑郁等神经和精神症状，还可能会出现腹泻、消化不良、恶心、呕吐、口干、腹痛、厌食、便秘、味觉异常等消化道副作用。其和食物一起服用可以有效减少上述消化系统副作用的产生，在服药时缓慢饮用并保持同一时间间隔给药，可以有效减少左卡尼汀引起的胃肠道不适。