胃窦糜烂活检良性几率在95%以上，只有大约3%-5%几率活检为恶性。在胃镜操作过程中发现胃窦糜烂，操作者一般都会给病人取活检，来辅助判断糜烂的性质以指导病人的下一步治疗。活检良性几率的高低主要取决于操作者内镜下的诊断水平及活检精准性，还取决于病理医生的诊断水平。大部分糜烂都是良性的病变，操作者可以通过醋酸、靛胭脂染色及放大内镜下的表现来协糜烂的性质。如果是良性，给予抑制胃酸分泌的药物，如奥美拉唑等和保护胃黏膜的药物，如硫糖铝等治疗。如果是恶性，完全可以通过内镜下黏膜剥离术把病变粘膜完整切除以达到根治的目的。