眼睛有眼屎主要由细菌性结膜炎、病毒性结膜炎、免疫性结膜炎引起，具体如下：
1、细菌性结膜炎：细菌性结膜炎是眼科常见的疾病，根据发展的快慢可以分为超急性、急性或亚急性慢性结膜炎。细菌性结膜炎的共有体征为分泌物增多，分泌物可为脓性、黏脓性或浆液性，最常引起脓性分泌物的病原体是淋球菌，其他致病菌通常引起黏液脓性分泌物。患者早晨起来可以表现为睁眼困难、大量眼屎。
2、病毒性结膜炎：病毒性结膜炎是一种由病毒所引起的结膜炎，常可以合并水样分泌物，当继发细菌感染时也会出现脓性分泌物。
3、免疫性结膜炎：免疫性结膜炎是指结膜对外界过敏原的一种超敏反应，免疫性结膜炎的患者可以表现为黏稠、丝状分泌物增多。