导致嗓子疼，脖子两侧疼的疾病，主要包括以下几方面：1、考虑是由于急性上呼吸道感染引起的嗓子疼以及脖子两侧疼痛，主要由于近期感冒或者机体抵抗力下降等，导致机体上呼吸道感染，进而出现咳嗽、咳痰、发热以及嗓子疼痛，牵及脖子两侧疼痛等，通过行胸部X线片检查可明确。2、考虑是由于扁桃体，急性扁桃体炎或者扁桃体化脓等引起嗓子疼，脖子两侧疼痛等。扁桃体化脓引起的疼痛，都会伴有高热以及吞咽困难等不适，通过到五官科检查可明确。3、考虑是由于甲状腺疾病，多见于亚急性甲状腺炎引起嗓子疼，脖子两侧疼等，通过行甲状腺B超以及血常规检查可明确。当出现嗓子疼以及脖子两侧疼时，需要及时到医院五官科就诊，完善相关检查以明确，然后对症治疗。