治疗好植物神经功能紊乱是一种综合的治疗，要根据个体化的原则来进行选用不同的方法。首先要纠正患者的生活习惯睡眠习惯以及饮食习惯，清淡饮食，调整自己的心态，用自我催眠的方法来改善自己的情绪，调整植物神经紊乱。
同时还要用药物来治疗，因为植物神经紊乱造成的失眠、神经衰弱以及躯体症状，主要有安定类的药物可以抗焦虑，同时可以改善睡眠，以及5-羟色胺再摄取抑制剂，可以改善情绪和睡眠。去甲肾上腺素再摄取抑制剂可以改善躯体症状，通过综合的治疗方法，可以逐步改善植物神经功能紊乱。然后再在医生的指导下进行逐步减药，可以彻底治愈，但是一定要在医生的指导下，这种情况一般可能治疗时间要1-1.5年时间。