多数患儿治疗时可选用人工肛门，进行手术后应做好局部护理。婴儿出生后先天无肛门又叫做肛门闭锁症，是新生儿时期先天性的疾病，也是比较常见的一种，一种是低位型肛门闭锁，另一种是高位型肛门闭锁，主要表现为新生儿出生后胎粪无法正常排出，导致新生儿出现肠梗阻。
治疗时主要以手术治疗为主，低位型肛门闭锁患儿有肛门口，可进行肛门扩张术，6个月后再进行肛门形成术治疗，高位型肛门闭锁是属于先天性无肛症，在治疗时需要切开患儿的骶尾部和腹部，可以直接把直肠盲端脱至患儿正常肛门的部位，从而做成人工肛门。手术后注意局部换药和消毒，避免手术后感染。