后脑疼痛可能是原发性头疼，如紧张性头痛或者偏头痛。紧张性疼痛多由于休息不好、劳累、睡眠不足等因素造成，患者往往是后脑胀痛，也可以出现前额及双侧太阳穴的胀痛，不伴有恶心、呕吐，一般程度在轻到中度，可自行缓解。而偏头痛是反复发作的搏动样疼痛，多发生在一侧，以跳痛为主，严重时伴有恶心、呕吐、怕光等，部分病人会有视觉先兆。
两种头疼都是原发性头疼，没有器质性的病变。如果有突然的后脑疼痛，还要注意除外器质性病变，如脑出血、蛛网膜下腔出血、脑部肿瘤，应该及时的完善头颅CT或者磁共振检查。还有些病人后脑疼痛是由于全身疾病所造成，如突然的血压增高、长期睡眠不足等因素所造成。