晨起口苦、口臭是消化科常见主诉，可见于很多疾病，最为常见的疾病是胃肠功能紊乱合并胃食管反流。食道下段括约肌松弛可以使胃内的气味、内容物、胃酸、胃蛋白酶以及反流上来的胆汁一起反流入口腔中。尤其在夜间明显，夜间缺乏重力来对抗反流，故次日清晨患者会出现口苦、口臭。对于这种情况的治疗包括以下几个方面：
一、生活方式的调整，心平气和、细嚼慢咽、适当锻炼、减轻体重、戒烟、戒酒。
二、可以使用中和胃酸、吸附胆汁的药物，如铝碳酸镁、氢氧化铝、三硅酸镁等药物均有效果。
三、抑制胃酸的药物，临床常用质子泵抑制剂。
四、调节胃肠蠕动的药物，可使用莫沙必利、西尼必利、曲美布汀等药物对胃肠动力进行调整。