根管治疗第二次换药是否会疼，要看牙髓腔里的所有牙髓，是不是全部杀死而且清除，如果牙髓腔内没有活髓，第二次换药是不会疼的；如果牙髓腔内还有存活的牙髓，换药的时候还是会有疼痛感。
根管治疗是一个比较复杂的操作过程，需要去医院数次才可以完成，第一次去会将牙髓腔打开，封一个失活剂；第二次去时扩充根管，将已经杀死的牙髓全部取出后封药；第三次去时对根管进行充填。
之后就可以根据牙齿的情况，采取补牙修复或者也可以套烤瓷冠，如果第一次就已经将牙神经取出，第二次换药是为了促进根尖的消炎，这种情况换药是不会有疼痛感的。