睾丸隐痛的原因比较复杂，通常睾丸附睾炎可以导致该类症状的出现，这是由于细菌逆行感染造成。因此，在临床上通常适宜抗感染治疗为主，抗感染治疗可以根据药敏的结果，选用合适的药物，或者根据经验用药。喹诺酮类、头孢类、青霉素类、氨基糖苷类、磷霉素类均有一定的效果，临床上可以采用，效果不好可以根据药敏换用其他的药物。
精索静脉曲张也会导致睾丸的隐痛，可以采用迈之灵这类药物，来改善静脉的回流，从而改善症状。突发的结石可能会向睾丸放射，以及泌尿系统的病变，如前列腺炎、泌尿系统的肿瘤、泌尿系统的结合，均可以引起睾丸的不适反应。因此，在临床上对于具体的病变，要根据具体的情况，选择对症治疗的药物。