甲亢时可发生肝脏损害，但是甲亢时发生的肝脏损害多是轻微的肝损害，大多数患者仅表现为转氨酶升高，很少发生肝细胞坏死以及肝硬化的情况，甲亢的肝细胞损害主要是由于高代谢症候群所导致，有时也可能是因为高代谢症候群时引起的肝细胞缺血、缺氧所导致。
在治疗的过程中有些药物对肝脏也有一定的损害，因人而异，有些患者可能没有伤害，有些患者会反应过激出现肝脏损害，所以在甲亢的治疗前和治疗过程中，都要及时复查肝脏功能、白细胞功能和甲状腺的功能，以免造成不必要的损伤。