孕妇除了可以使用软化耵聍的碳酸氢钠滴耳液，以及可以用于消炎、消毒作用硼酸酒精滴耳液，其它的抗菌素滴耳液都不可使用。因为目前抗菌素滴耳液，基本上都是喹喏酮类滴耳液，而喹喏酮类药物孕妇须禁用。而孕妇可以使用的头孢类或青霉素类药物，由于有引起严重过敏反射的副作用，所以无此类抗生素滴耳液。
如是慢性化脓性中耳炎或真菌性外耳道炎，可以选用硼酸酒精滴耳液，但刺激性大，滴耳后可出现耳部一过性剧烈疼痛，虽然滴耳液中喹喏酮类抗菌素含量不高，也尽量避免选用。如是化脓性中耳炎，需要脓液细菌培养后再选用敏感，并对孕妇无副作用的抗生素进行治疗。