男性发生尿道炎时需及时口服药物治疗，如口服盐酸多西环素、盐酸米诺环素、头孢克洛缓释片、红霉素肠溶片等药物序贯治疗4-6周左右，多数男性尿道炎引起的尿道刺痛、尿道刺痒和尿道口分泌物会明显好转。
男性发生尿道炎时还需口服磷霉素氨丁三醇散治疗，磷霉素氨丁三醇散对常见尿道致病菌有明显的抑菌和杀菌作用。
病人出现尿道炎时还需口服中成药物联合治疗，如口服八正胶囊治疗，多数男性尿频、尿急、尿痛的症状会明显好转。