乙型肝炎的根本治疗是抗病毒治疗，目前一线口服抗病毒药物包括恩替卡韦、富马酸替诺福韦酯和富马酸丙酚替诺福韦片，可选择其中一种药物进行抗病毒治疗。
用药前应进行肝功、乙肝病毒DNA、乙肝五项、血常规、血肌酐、血磷、肾功能等检查。
用药过程中每3个月复查1次上述指标，1年后如果病情稳定每6个月复查1次，切忌达不到停药标准，一定不能随意停药，以避免出现病毒反弹、肝损害加重，甚至出现肝功衰竭。
另外，除抗病毒治疗外，可根据肝脏损害程度应用抗炎保肝药物，如甘草酸制剂、水飞蓟素制剂、多不饱和卵磷脂制剂和双环醇等，可选择1-2种药物，但不易多种联合应用。