桥本甲状腺炎发生甲状腺功能减退症因人而异，有些患者3-5年就可能发生甲状腺功能减退症，有些患者10年、8年，甚至终生，只是出现甲状腺抗体的升高，并没有发生甲状腺功能减退症，所以是因人而异的。
并不是每个桥本甲状腺疾病的患者都会发生甲状腺功能减退症，这是和自身免疫攻击的损伤程度相关的。有一些患者在青春期或者育龄期就发生了抗体升高，但是甲状腺功能的水平一直处于正常状态。这是由于桥本甲状腺炎时，淋巴细胞逐渐代替了甲状腺组织，致使甲状腺激素的合成、分泌逐渐减少。有些患者进展的快，有些患者进展的慢，所以不一定每个患者都会发展成甲减。