生理性卵巢囊肿一般多为单侧，直径为3cm左右，壁比较薄，超声下透声比较好，边界比较清楚。妇科检查中包块活动度比较好，为囊性，没有压痛，2-3个月可以自行消退。病理性囊肿可能会持续存在，并且在超声下会发现囊肿内液性暗区有比较多的杂乱光团，另外还有明显的血流信号，界限也不是很清楚，妇科检查囊肿多固定、有压痛。另外，囊肿多呈实性或者囊实性，生长比较迅速，病程也比较短。
另外，对于一些恶性囊肿，可能会伴有消瘦、恶病质的一些表现，肿瘤标志物也会有明显的升高，所以这部分的囊肿大多数为病理性囊肿。病理性囊肿通常是需要进行手术切除，根据术后的病理来判断是哪种性质的肿瘤。