灰指甲医学上叫做甲真菌病或者是甲癣，是由皮肤癣菌或其他致病真菌感染指甲的甲板所引起的病变。它的病因主要是皮肤癣菌，包括红色毛癣菌、须癣毛癣菌、絮状表皮癣菌等，还有一些酵母菌，比如念珠菌、马拉色菌等引起。传染源主要是一些患有皮肤癣菌病的人，或者是自身的手癣、足癣直接的蔓延到了指甲，就形成了灰指甲。
由于这些皮肤癣菌能够产生一些角蛋白酶破坏甲板，就可以引起甲板混浊、变色，如变黄，凸凹不平，甲下有很多角质碎屑堆积，这样就形成灰指甲的典型临床表现。对于灰指甲，以前治疗困难，但是现在已经有很好的内服和外用抗真菌药物，所以出现了灰指甲以后也不要灰心，只要及时的到医院就诊，规范的治疗，大多数灰指甲都是可以痊愈。