阿托品治疗散瞳之后的副作用，主要包括以下几个方面：
第一、阿托品散瞳之后睫状肌处于麻痹的状态，患者看近处会看不清，但是看远处跟原来一样不受影响。但是阿托品散瞳持续的时间大概在三周左右，所以在这期间患者近距离的工作是要受到影响的。
第二、阿托品散瞳之后瞳孔扩大，进入眼内的光线增多，患者会有畏光的表现，所以在阳光比较强烈的地方建议患者佩戴眼镜。
第三、如果阿托品散瞳用药的时候大量的被吸收到全身，会导致全身的副作用，有松弛平滑肌的作用，还有减少腺体分泌的作用，所以使用阿托品之后，儿童会出现面部的潮红、口干，成年人可能会加重尿潴留，可能出现便秘等，所以前列腺肥大的患者和尿潴留的患者是禁止使用的。长期使用抗精神类的药物的患者，阿托品的联合使用可能会加重药物反应，所以阿托品也是要慎用的。
阿托品散瞳在临床中主要是用于儿童屈光的检查，以及虹膜睫状体炎的治疗，还有的是玻璃体切割手术之后的护理。所以阿托品散瞳其实在临床上现在最主要应用的还是在儿童散瞳验光方面，而对于儿童散瞳验光，阿托品的好处是远远大于副作用的，因为有的儿童的屈光状态中是包含有假性近视的，假性近视是因为长时间近距离用眼导致调节痉挛所引起的，阿托品散瞳可以完全去除假性近视，使眼睛的视力恢复正常。所以，阿托品散瞳对儿童而言利大于弊。为了减少全身副作用，使用阿托品药水时，可以嘱咐患者用药后压迫眼角1-2分钟，可以减少眼角泪小点对眼药水的吸收，从而减少进入全身的药量。
