排尿时小腹疼痛在女性和男性中，其常见的原因不同。女性最常见的原因是膀胱炎，除了排尿时小腹疼痛，往往还有尿频、尿急、尿痛，如果化验尿液，通常白细胞或者是细菌量明显增加。对于男性来讲，排尿时小腹痛最常见的是尿道炎或者是前列腺炎。
尿道炎通常还伴有尿频、尿急、尿痛，尿道分泌物的增加，可以为黄色的脓性，或者是稀薄的脓性分泌物，尿道炎一般是病原体感染所导致。前列腺炎与尿道炎的区别在于排尿时可以有尿不尽感、排尿困难等等症状，有时会阴会有胀痛的感觉，由于前列腺炎大多数是由非感染因素所导致，所以化验尿液常常正常，或者是症状虽然明显，但是只有少量的白细胞或者红细胞。