乙肝大三阳在乙肝二对半的化验中，主要是乙肝表面抗原、乙肝E抗原、乙肝核心抗体阳性，而乙肝小三阳它主要是乙肝表面抗原、乙肝E抗体、乙肝核心抗体阳性，因此大三阳和小三阳最重要的区别就是乙肝E抗原、乙肝E抗体的区别。
无论是乙肝大三阳，还是乙肝小三阳，都属于乙肝携带者，传染性和严重性主要有乙肝病毒DNA和肝功能所决定。如果肝功能完全正常，说明只是乙肝健康的携带者，不需要任何药物治疗。如果乙肝病毒DNA明显升高，伴有肝功能异常，就说明有肝炎发作，肝炎发作期需要口服抗病毒药物，且进行保肝治疗改善肝功能。