肾结石反复高热、感染，需要要到医院进行治疗，必要时甚至需要住院治疗。首先需要进行尿培养和药物敏感试验检查，明确具体的感染菌，针对性的选择抗菌素来进行抗感染治疗，使体温逐渐恢复至正常。然后再进一步的处理结石，如果结石比较小，小于2cm，不伴有中度以上的肾脏积水，则可以首先进行体外冲击波碎石。经过碎石治疗以后，定期复查，观察排石的情况。
如果结石体积比较大，超过2cm，并且伴有中度以上的肾脏积水，则建议等待感染控制以后进行手术治疗，可以选择经皮肾镜钬激光碎石，也可以选择输尿管软镜钬激光碎石治疗，清除体内的结石，达到完全康复的状态。对于体温过高的患者，必要时需要退热处理，比如肌肉注射柴胡注射液、安痛定注射液等，以免长时间的高热而造成体液丢失过多，引发其他系统的疾病，比如出现感染性休克、惊厥等。