胚胎停育大多数是发生在妊娠早期，妊娠早期的胚胎停育大多数是与胎儿染色体异常以及病毒感染有关。染色体异常导致胚胎停育的发生几率是大约占到60%左右，在妊娠中期、妊娠晚期如果出现胎死宫内的情况，大多数不是胎儿染色体异常的问题，有可能是感染因素造成的，比如TROCH，也就是弓形虫，巨细胞病毒、单纯疱疹病毒等病毒感染。另外，还可能与胎盘和脐带功能不良有关，尤其是有基础病的病人，比如妊娠期高血压疾病、妊娠期糖尿病等造成的胎盘血管病变是造成胎死宫内的原因。另外，由于脐带的过度扭转、脐带打结造成脐带的血栓形成，或者血供阻断引起胎死宫内的情况也是主要原因。