早期肝癌通常不会误诊，如果是单向检查，这种情况下有可能会出现误差。如果怀疑早期肝癌，多会进行多项检查以综合判定。所以，此种情况误诊的可能性比较少，除非是某些情况本身诊断不明可能会误诊。
如果B超、CT、磁共振等都确认为早期肝癌，误诊的概率极低。另外，也可以结合血液学的肿瘤标志物检测综合判定。如果甲胎蛋白超过1000μg/L，此时基本可以确诊。最终要100%的确诊，通常需要考虑切除后病理组织切片，如此才能够真正确诊。所以，临床上的疾病在没有得到病理的情况下，都无法100%的确定。