如果是妊娠、哺乳的妇女以及八岁以下的小儿，使用四环素牙膏经常刷牙，有可能会引起牙齿着色，形成四环素牙，或者可以沉积到牙、骨骼、指甲，还可以引起牙釉质发育不全。
如果长期使用四环素牙膏，四环素使用过多以后会引起细菌的耐药性，如果以后出现细菌感染，再使用四环素进行抗菌治疗可能就无效了。长期使用四环素牙膏，除了造成细菌对四环素耐药以外，还有可能会造成二重感染。
也就是出现真菌的感染，可能会形成口腔的白色念珠菌病。所以除非必要的情况下，不要经常使用四环素牙膏，或者其他的含有抗生素的牙膏经常刷牙。