牙龈肿出脓包最常见的原因是龋齿、蛀牙，或者牙齿外伤、牙齿发育畸形等，造成牙髓感染没有能够得到及时治疗，感染通过根管进一步扩散到根尖，形成根尖脓肿，造成牙龈肿出脓包。这种情况出现之后首先要对牙齿进行开放处理，同时对脓包进行切开引流，控制急性炎症，在急性炎症控制之后需要拍片进行根管治疗，如果牙齿已经没有保留价值，只是根尖炎症，就需要拔除相应的残根，做进一步的修复治疗。
牙龈肿出脓包另外的原因有可能是牙周炎造成的牙周脓肿，首先处理还是要进行急性炎症的控制。牙周脓肿可以进行切开引流，急性炎症消退之后，再进行牙周炎的相应治疗。