腹股沟斜疝先天性疝的发病因素主要是鞘状突未闭或者是闭锁不全，一般在胚胎早期睾丸位于腹膜后第2-3腰椎旁，以后逐渐下降。同时在未来的腹股沟管深环处带动腹膜、腹横筋膜以各肌筋膜组织，腹股沟管逐渐下移，并且推动皮肤而形成阴囊。随之下移的腹膜形成鞘突，睾丸紧贴在其后壁，婴儿出生后不久，鞘突下段会形成睾丸的固有筋膜，其余部分自行闭锁而形成纤维索带。
如果鞘状突不闭锁或者闭锁不完全，就会成为先天性的腹股沟斜疝的疝囊。右侧睾丸下降比左侧略晚，鞘状突的闭锁也比较迟，因而在临床上右侧疝相对比较多见。