细菌性痢疾常见的并发症有菌血症、溶血尿毒症综合征、关节炎等，大致情况如下：
1、菌血症：主要见于儿童，患儿常营养不良、镰状细胞贫血及免疫功能低下，目前国内有少数病例报道，合并菌血症的患者症状比较严重，病死率很高，菌血症多发生于发病后1-2天，抗生素治疗有效。
2、溶血尿毒症综合征：主要见于痢疾志贺氏菌感染，有些病例开始有类似白血病反应，进而出现贫血以及DIC，部分严重的病例可以出现急性肾功能衰竭，患者发病主要与内毒素血症有关，但其他细菌引起的内毒素血症并无类似表现。本病预后严重，要给予积极的激素对症治疗，严重时需要进行透析治疗。
3、关节炎：多发生在细菌性疾痢后两周内，可能是变态反应所致，主要累及大关节，可以引起膝踝关节红肿、渗液，关节液中可以查到凝集的志贺菌抗体，血清抗O抗体正常，可以应用激素治疗，应用激素治疗后很快就会缓解。