患者出现咽喉部脓肿化脓时，常出现的是化脓性扁桃体炎，是一种扁桃体急性炎症性疾病，程度比较重，患者咽痛程度也会比较重，常会引起患者出现吞咽、进食困难等。在此情况下，患者需要积极使用抗生素药物治疗，常用青霉素类或头孢菌素类抗生素。病情程度较重时，往往需要采取静脉输液的治疗方式，并需要酌情联合使用地塞米松等激素类药物。
此外，也有部分扁桃体化脓患者，会进一步出现扁桃体周围炎、扁桃体周围脓肿等局部并发症。如果形成的脓肿比较明显时，就往往需要进一步采取穿刺抽脓，或者切开引流的处理措施。